El HRAEPY es un organismo dependiente de la Secretaría de Salud Federal, dentro del marco de la Comisión Coordinadora de Institutos Nacionales de Salud y Hospitales de Alta Especialidad, componente del Sistema de Protección Social en Salud, con un área de influencia planeada para abarcar los estados de Yucatán, Campeche y Quintana Roo, a favor de una población total de 3,823,231habitantes; de los cuales el 49% no se encuentran afiliados a ningún sistema organizado de atención a la salud.

El Hospital Regional de Alta Especialidad de la Península de Yucatán, es un hospital como su nombre lo dice, de Alta Especialidad, con planeación orientada para la tarea de cumplir con este cometido de manera específica. Es un Hospital Federal de Referencia al servicio de los estados del Sureste de la Nación, que propone romper con los viejos esquemas de atención a la salud basado en niveles de atención, cuya estructura, organización y funcionalidad esta ineludiblemente planeadas para abocarse a la atención de problemas de salud de intensa complejidad que ameritan para su resolución alta especialidad en la infraestructura biomédica y excelencia en la formación, capacitación y organización profesional, poniéndose al alcance regional y socioeconómico de dónde y de quiénes lo ameritan

Misión: Contribuir al cumplimiento del derecho a la protección de la salud y coadyuvar en el fortalecimiento del Sistema Nacional de Salud proporcionando a la población de la región sureste del país, servicios médicos de la más alta calidad científica y humanista para la atención de problemas de alta complejidad con recursos humanos especializados, impulsando el desarrollo de investigación para generar conocimientos pertinentes y significativos, para su prevención, limitación y resolución, e implementando programas de formación y capacitación de profesionales, especialistas y técnicos del área de la salud con profunda sensibilidad y compromiso social
Visión: Ser una institución líder en atención a la salud, modelo de acreditación y certificación, integrada a la red de servicios médicos de la Península de Yucatán y Nacional, innovadora en estructura, organización y funcionalidad, con altos estándares de calidad y de seguridad, que a través de abordajes clínicos multidisciplinarios, investigación significativa y formación de nuevos profesionales de alta calidad, sea resolutiva de demanda, y referencia de alta especialidad
Un poco de historia